かずさゲノムテクノロジーズ株式会社

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NGS解析

次世代シーケンス受託サービス

次世代シーケンサー(HiSeq 1500, HiSeq 2500, NextSeq 500, MiSeq[イルミナ社])を使用した変異解析や発現解析などの各種受託解析を承っております。解析用途に合わせたライブラリー作製の工程のみの受託、あるいは作製されたライブラリーをお預かりしてシーケンスのみの受託も対応しております。
次世代シーケンサ(NGS)を用いた解析を日々行なっている皆様から、これからNGSの利用を考えている皆様まで、幅広くご利用いただけるサービスをご用意いたしました。なお、本サービスは、NGSを用いたゲノム解析で数多くの成果を上げているかずさDNA研究所の協力のもとで提供しております。

【注意事項】

  • サービスの内容:ゲノム解析、発現解析、エピジェネティクス関連およびレーン貸切は、Fastq ファイルと作業報告書の入ったDVD またはHDD を納品いたします。
  • 送付サンプルは必ず抽出したDNA またはRNA または調製済みライブラリーの状態にしてお送りください。
  • 細胞・組織などの状態でのサンプル受け取りはできません。
  • サンプル量および品質が下記リスト記載の量に満たない場合でも、解析可能な場合がございます。予めご相談ください。
  • データ解析のみのご依頼の場合:依頼書記載のサンプル名称と、データにご登録されている名称は統一してください。ヒトサンプルの場合は匿名化をお願いいたします。作業内容ならびにお見積もり内容の確定後にデータをご送付ください。
  • 1 細胞NGS 解析(RNA-seq、TCR、BCR) も承っております。詳細はお問い合せください。
ロングリード(PacBio Sequel)
解析メニュー 作業内容 取得データ目安 必要サンプル量 納 期
RNA ライブラリ調製+
シーケンサーラン
40万 - 60万リード 8週間
DNA 4Gb - 7Gb(DNAの品質による) DNA: 10μg以上(40〜50 kb以上)で
4セルまで
5セル以上の場合は4セルごとに10μgを
追加してご送付ください。
QC結果によりDNAに分解が見られた場合は
10μg以上必要な場合もあります。
*本料金には、DNAのQC料金も含まれて
います。
8週間
ゲノム解析
品質確認はオプションとなります。
解析メニュー 作業内容 取得データ目安 必要サンプル量 納 期
全ゲノムシークエンス ライブラリ調製+
シーケンサーラン
ご依頼内容ごとに設定 DNA:2 μg以上
(100 ng/μL以上)
4週間〜
Human Exome-Seq
(100bp Paired-End)
ライブラリ調製+
シーケンサーラン
8,000万リード、8Gb DNA:2 μg以上
(100 ng/μL以上)
8週間
発現解析
RNA品質検査を含みます。弊社推奨基準を満たさない場合、解析中止、もしくはサンプルの再提出をお願いすることがございます。品質検査は2回目までは無償で、3回目以降は別途料金が発生いたします。
解析メニュー 作業内容 取得データ目安 必要サンプル量 納 期
真核生物 mRNA-Seq
(TypeA; 50 bp Single-Read)
ライブラリ調製+
シーケンサーラン
1,500万リード、750Mb total RNA:2 μg以上
(40 ng/μL以上)
4週間
真核生物 mRNA-Seq
(TypeB; 100 bp Paired-End)
ライブラリ調製+
シーケンサーラン
3,000万リード、3Gb total RNA:2 μg以上
(40 ng/μL以上)
8週間
miRNA-Seq
(50bp Single-Read)
ライブラリ調製+
シーケンサーラン
1,500万リード、750Mb total RNA:4 μg以上
(200 ng/μL以上)
2〜4週間
エピジェネティクス関連
品質確認はオプションとなります。
解析メニュー 作業内容 取得データ目安 必要サンプル量 納 期
Human Bisulfite-Seq
(100 bp Paired-End)
ライブラリ調製+
シーケンサーラン
3,000万リード、3Gb DNA:4 μg以上
(100 ng/μL以上)
8週間〜
MBD-Seq
(100bp Paired-End)
ライブラリ調製+
シーケンサーラン
3,000万リード、3Gb DNA:4 μg以上
(100 ng/μL以上)
8週間〜
ChIP-Seq
(50 bp Single-Read)
ライブラリ調製+
シーケンサーラン
ご依頼内容ごとに設定 クロマチン免疫沈降後DNA:
100 ng以上(10 ng/μL以上)
お問い合わせ
ライブラリ調製
品質確認はオプションとなります。
解析メニュー 作業内容 取得データ目安 必要サンプル量 納 期
mRNA-Seq(Type A)用サンプル
(50 bp, Single-Read)
ライブラリ調製
(RNA)
納品物は作製済みの
ライブラリーとなります。
total RNA:2 μg以上
(40 ng/μL以上)
3週間
mRNA-Seq(Type B)用サンプル
(100 bp, Paired-End)
ライブラリ調製
(RNA)
total RNA:2 μg以上
(40 ng/μL以上)
3週間
Human Exome-Seq用サンプル
(100 bp, Paired-End)
ライブラリ調製
(DNA)
DNA:2 μg以上
(100 ng/μL以上)
3週間
全ゲノム、Target-Seq用 ライブラリ調製
(DNA)
DNA:2 μg以上
(100 ng/μL以上)
3週間
シーケンサーラン
品質確認はオプションとなります。
解析メニュー 作業内容 取得データ目安 必要サンプル量 納 期
NextSeq 75 bp Single-Read レーン貸切
シーケンサーラン
4億リード、最大30Gb 4週間
75bp Paired-End Mid 2.6億リード、最大 19.5Gb
150bp Paired-End Mid 2.6億リード、最大39 Gb
75 bp Paired-End 8億リード、最大60 Gb
150 bp Paired-End 8億リード、最大120 Gb
MiSeq 150 bp Paired-End 2700万リード、4 Gb 4週間
250 bp Paired-End 2700万リード、6.7 Gb
300 bp Paired-End 4,700万リード、14.1 Gb
150 bp Paired-End Nano 200万リード、300 Mb
250 bp Paired-End Nano 200万リード、500 Mb
HiSeq 50 bp Single-Read 1.86億リード、9.3 Gb 8週間
3億リード、15 Gb 4週間
100 bp Paired-End 3.74億リード、37.4 Gb 8週間
6億リード、60 Gb 4週間

抗体可変領域解析

5'-RACE法により5'UTRから定常領域までの塩基配列を取得し、シグナル配列部分の開始メチオニンから可変領域の末端部分までの配列を報告します。かずさDNA研究所では大規模cDNAプロジェクトでの経験を生かし、抗体産生細胞からRNA抽出を行い、迅速な可変領域配列の決定を行います。

解析メニュー 納 期
基本解析 3~4週間
CDR同定 1~2週間