次世代シーケンサー（HiSeq 1500, HiSeq 2500, NextSeq 500, MiSeq［イルミナ社］）を使用した変異解析や発現解析などの各種受託解析を承っております。解析用途に合わせたライブラリー作製の工程のみの受託、あるいは作製されたライブラリーをお預かりしてシーケンスのみの受託も対応しております。
次世代シーケンサ（NGS）を用いた解析を日々行なっている皆様から、これからNGSの利用を考えている皆様まで、幅広くご利用いただけるサービスをご用意いたしました。なお、本サービスは、NGSを用いたゲノム解析で数多くの成果を上げているかずさDNA研究所の協力のもとで提供しております。
【注意事項】
- サービスの内容：ゲノム解析、発現解析、エピジェネティクス関連およびレーン貸切は、Fastq ファイルと作業報告書の入ったDVD またはHDD を納品いたします。
- 送付サンプルは必ず抽出したDNA またはRNA または調製済みライブラリーの状態にしてお送りください。
- 細胞・組織などの状態でのサンプル受け取りはできません。
- サンプル量および品質が下記リスト記載の量に満たない場合でも、解析可能な場合がございます。予めご相談ください。
- データ解析のみのご依頼の場合：依頼書記載のサンプル名称と、データにご登録されている名称は統一してください。ヒトサンプルの場合は匿名化をお願いいたします。作業内容ならびにお見積もり内容の確定後にデータをご送付ください。
- 1 細胞NGS 解析（RNA-seq、TCR、BCR） も承っております。詳細はお問い合せください。
ロングリード（PacBio Sequel）
| 解析メニュー | 作業内容 | 取得データ目安 | 必要サンプル量 | 納 期 |
|---|---|---|---|---|
| RNA | ライブラリ調製＋ シーケンサーラン |
40万 - 60万リード | 8週間 | |
| DNA | 6Gb - 10Gb（DNAの品質による） | DNA： 10μg以上（40〜50 kb以上）で 4セルまで 5セル以上の場合は4セルごとに10μgを 追加してご送付ください。 QC結果によりDNAに分解が見られた場合は 10μg以上必要な場合もあります。 ＊DNAのクオリティチェック（初回分）は、 メニューに含まれています。 |
8週間 |
ゲノム解析
| 解析メニュー | 作業内容 | 取得データ目安 | 必要サンプル量 | 納 期 |
|---|---|---|---|---|
| 全ゲノムシークエンス | ライブラリ調製＋ シーケンサーラン |
ご依頼内容ごとに設定 | DNA：2 μg以上 （100 ng/μL以上） |
4週間〜 |
| Human Exome-Seq (100bp Paired-End) |
ライブラリ調製＋ シーケンサーラン |
8,000万リード、8Gb | DNA：2 μg以上 （100 ng/μL以上） |
8週間 |
発現解析
| 解析メニュー | 作業内容 | 取得データ目安 | 必要サンプル量 | 納 期 |
|---|---|---|---|---|
| 真核生物 mRNA-Seq （TypeA； 50 bp Single-Read） |
ライブラリ調製＋ シーケンサーラン |
1,500万リード、750Mb | total RNA：2 μg以上 （40 ng/μL以上） |
4週間 |
| 真核生物 mRNA-Seq （TypeB； 100 bp Paired-End） |
ライブラリ調製＋ シーケンサーラン |
3,000万リード、3Gb | total RNA：2 μg以上 （40 ng/μL以上） | 8週間 |
| miRNA-Seq (50bp Single-Read) |
ライブラリ調製＋ シーケンサーラン |
1,500万リード、750Mb | total RNA：4 μg以上 （200 ng/μL以上） |
2〜4週間 |
エピジェネティクス関連
| 解析メニュー | 作業内容 | 取得データ目安 | 必要サンプル量 | 納 期 |
|---|---|---|---|---|
| Human Bisulfite-Seq （100 bp Paired-End） |
ライブラリ調製＋ シーケンサーラン |
3,000万リード、3Gb | DNA：4 μg以上 （100 ng/μL以上） |
8週間〜 |
| MBD-Seq (100bp Paired-End) |
ライブラリ調製＋ シーケンサーラン |
3,000万リード、3Gb | DNA：4 μg以上 （100 ng/μL以上） |
8週間〜 |
| ChIP-Seq （50 bp Single-Read） |
ライブラリ調製＋ シーケンサーラン |
ご依頼内容ごとに設定 | クロマチン免疫沈降後DNA： 100 ng以上（10 ng/μL以上） |
お問い合わせ |
ライブラリ調製
| 解析メニュー | 作業内容 | 取得データ目安 | 必要サンプル量 | 納 期 |
|---|---|---|---|---|
| mRNA-Seq（Type A）用サンプル （50 bp, Single-Read） |
ライブラリ調製 （RNA） |
納品物は作製済みの ライブラリーとなります。 |
total RNA：2 μg以上 （40 ng/μL以上） |
3週間 |
| mRNA-Seq（Type B）用サンプル （100 bp, Paired-End） |
ライブラリ調製 （RNA） |
total RNA：2 μg以上 （40 ng/μL以上） |
3週間 | |
| Human Exome-Seq用サンプル （100 bp, Paired-End） |
ライブラリ調製 （DNA） |
DNA：2 μg以上 （100 ng/μL以上） |
3週間 | |
| 全ゲノム、Target-Seq用 | ライブラリ調製 （DNA） |
DNA：2 μg以上 （100 ng/μL以上） |
3週間 |
シーケンサーラン
| 解析メニュー | 作業内容 | 取得データ目安 | 必要サンプル量 | 納 期 | |
|---|---|---|---|---|---|
| NextSeq | 75 bp Single-Read | レーン貸切 シーケンサーラン |
4億リード、最大30Gb | 4週間 | |
| 75bp Paired-End Mid | 2.6億リード、最大 19.5Gb | ||||
| 150bp Paired-End Mid | 2.6億リード、最大39 Gb | ||||
| 75 bp Paired-End | 8億リード、最大60 Gb | ||||
| 150 bp Paired-End | 8億リード、最大120 Gb | ||||
| MiSeq | 150 bp Paired-End | 2700万リード、4 Gb | 4週間 | ||
| 250 bp Paired-End | 2700万リード、6.7 Gb | ||||
| 300 bp Paired-End | 4,700万リード、14.1 Gb | ||||
| 150 bp Paired-End Nano | 200万リード、300 Mb | ||||
| 250 bp Paired-End Nano | 200万リード、500 Mb | ||||
| HiSeq | 50 bp Single-Read | 1.86億リード、9.3 Gb | 8週間 | ||
| 3億リード、15 Gb | 4週間 | ||||
| 100 bp Paired-End | 3.74億リード、37.4 Gb | 8週間 | |||
| 6億リード、60 Gb | 4週間 | ||||
抗体可変領域解析
5'-RACE法により5'UTRから定常領域までの塩基配列を取得し、シグナル配列部分の開始メチオニンから可変領域の末端部分までの配列を報告します。かずさDNA研究所では大規模cDNAプロジェクトでの経験を生かし、抗体産生細胞からRNA抽出を行い、迅速な可変領域配列の決定を行います。
| 解析メニュー | 納 期 |
|---|---|
| 基本解析 | 3～4週間 |
| CDR同定 | 1～2週間 |