次世代シーケンサー(NGS)を使用した変異解析や発現解析などの各種受託解析を承っております。解析用途に合わせたライブラリー作製の工程のみの受託、あるいは作製されたライブラリーをお預かりしてシーケンスのみの受託も対応しております。
NGSを用いた解析を日々行っている皆様から、これからNGSの利用を考えている皆様まで、幅広くご利用いただけるサービスをご用意いたしました。なお、本サービスは、NGSを用いたゲノム解析で数多くの成果を上げているかずさDNA研究所の協力のもとで提供しております。
- 使用機器
NextSeq 500, NextSeq2000, MiSeq[イルミナ社]
PacBio Sequel II, PacBio Sequel IIe [PacBio社] - DNBSEQ-G400RS [MGI社]
- 1細胞NGS 解析(RNA-seq、TCR、BCR) も承っております。詳細はお問い合せください。
解析メニュー
サンプルは1個から承ります。
サンプル量および品質が下記リスト記載の量に満たない場合でも、解析可能な場合がございます。予めご相談ください。
取得データ量は目安の数値であり、それらのデータ量を保証するものではありません。
ロングリード(PacBio Sequel II)
解析メニュー | 取得データ目安 | 必要サンプル量 | 納 期 |
---|---|---|---|
RNA | 400万 - 500万well由来のリード | Total RNA:4 μg以上(100 ng/ul以上) | 8-12週間 (4セルの場合は8週間) |
DNA | HiFi Read: 10-30Gb (HiFiデータ作製後) continuous long read: 90-130Gb (DNAの品質による) |
HiFi read: 30ug以上 continuous long read: 20ug以上 QC結果によりDNAに分解が見られた場合は、さらに多くのDNAが必要となる場合があります。 |
8-12週間 (4セルの場合は8週間) |
HiFiデータ作成(オプションメニュー) | - | - | 2週間 |
ゲノム解析
解析メニュー | 取得データ目安 | 必要サンプル量 | 納 期 |
---|---|---|---|
全ゲノムシークエンス | ご依頼内容ごとに設定 | DNA:2 μg以上 (100 ng/μL以上) |
4週間〜 |
Human Exome-Seq (150bp Paired-End)アジレントV6 or V7 |
4,000万リード、6Gb | DNA:2 μg以上 (100 ng/μL以上) |
8週間 |
発現解析
解析メニュー | 取得データ目安 | 必要サンプル量 | 納 期 |
---|---|---|---|
真核生物 mRNA-Seq (TypeA; 75 bp Single-Read) |
1,500万リード、1125Mb | total RNA:2 μg以上 (40 ng/μL以上) |
4週間 |
真核生物 mRNA-Seq (TypeB; 75 bp Paired-End) |
3,000万リード、2.25Gb | total RNA:2 μg以上 (40 ng/μL以上) | 8週間 |
miRNA-Seq (75bp Single-Read) |
1,500万リード、1125Mb | total RNA:4 μg以上 (200 ng/μL以上) |
8週間 |
3'RNA-Seq | 100万リード | total RNA:2 μg以上 (40 ng/μL以上) |
8週間 |
シングルセル3’RNA Seq | 100万リード | シングルセル | 8週間 |
エピジェネティクス関連
解析メニュー | 取得データ目安 | 必要サンプル量 | 納 期 |
---|---|---|---|
Human Bisulfite-Seq (75 bp Paired-End) |
3,000万リード、2.25Gb | DNA:4 μg以上 (100 ng/μL以上) |
8週間〜 |
MBD-Seq (75bp Paired-End) |
3,000万リード、2.25Gb | DNA:4 μg以上 (100 ng/μL以上) |
8週間〜 |
ChIP-Seq (75 bp Single-Read) |
ご依頼内容ごとに設定 | クロマチン免疫沈降後DNA: 100 ng以上(10 ng/μL以上) |
お問い合わせ |
ライブラリ調製
解析メニュー | 取得データ目安 | 必要サンプル量 | 納 期 |
---|---|---|---|
mRNA-Seq用 | 納品物は作製済みの ライブラリーとなります。 |
total RNA:2 μg以上 (40 ng/μL以上) |
3週間 |
Total RNA-Seq用 | total RNA:2 μg以上 (40 ng/μL以上) |
3週間 | |
Human Exome-Seq用 | DNA:2 μg以上 (100 ng/μL以上) |
3週間 | |
全ゲノム、Target-Seq用 | DNA:2 μg以上 (100 ng/μL以上) |
3週間 |
シーケンサーラン(レーン貸切)
解析メニュー | 取得データ目安 | 必要サンプル量 | 納 期 | |
---|---|---|---|---|
NextSeq | 75 bp Single-Read | 4億リード、最大30Gb | 4週間 | |
75bp Paired-End Mid | 2.6億リード、最大 19.5Gb | |||
150bp Paired-End Mid | 2.6億リード、最大39 Gb | |||
75 bp Paired-End | 8億リード、最大60 Gb | |||
150 bp Paired-End | 8億リード、最大120 Gb | |||
MiSeq | 150 bp Paired-End | 2,700万リード、4 Gb | 4週間 | |
250 bp Paired-End | 2,700万リード、6.7 Gb | |||
300 bp Paired-End | 4,700万リード、14.1 Gb | |||
150 bp Paired-End Nano | 200万リード、300 Mb | |||
250 bp Paired-End Nano | 200万リード、500 Mb | |||
DNBSEQ-G400RS | 50 bp Single-Read | 16億リード、80 Gb | 8週間 | |
100 bp Single-Read | 16億リード、160 Gb | |||
400 bp Single-Read | 16億リード、640 Gb | |||
100 bp Paired-End | 32億リード、320 Gb | |||
150 bp Paired-End | 32億リード、480 Gb | |||
200 bp Paired-End | 32億リード、640 Gb | |||
イルミナライブラリConversion費用 | Conversionを実施(ランは含みません) | 3週間 |
ライブラリのクオリティチェック
解析メニュー | 納 期 |
---|---|
クオリティチェック(バイオアナライザー) | 1週間 |
濃度測定(定量PCR) | 1週間 |
抗体可変領域解析
5'-RACE法により5'UTRから定常領域までの塩基配列を取得し、シグナル配列部分の開始メチオニンから可変領域の末端部分までの配列を報告します。かずさDNA研究所では大規模cDNAプロジェクトでの経験を生かし、抗体産生細胞からRNA抽出を行い、迅速な可変領域配列の決定を行います。
解析メニュー | 納 期 |
---|---|
基本解析 | 3~4週間 |
CDR同定 | 1~2週間 |