かずさゲノムテクノロジーズ株式会社

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NGS解析受託サービス

NGS解析受託サービス

次世代シーケンサー(NGS)を使用した変異解析や発現解析などの各種受託解析を承っております。解析用途に合わせたライブラリー作製の工程のみの受託、あるいは作製されたライブラリーをお預かりしてシーケンスのみの受託も対応しております。
NGSを用いた解析を日々行っている皆様から、これからNGSの利用を考えている皆様まで、幅広くご利用いただけるサービスをご用意いたしました。なお、本サービスは、NGSを用いたゲノム解析で数多くの成果を上げているかずさDNA研究所の協力のもとで提供しております。

  • 使用機器
    HiSeq 1500, HiSeq 2500, NextSeq 500, MiSeq[イルミナ社]
    PacBio Sequel [PacBio社]
  • 1細胞NGS 解析(RNA-seq、TCR、BCR) も承っております。詳細はお問い合せください。

サンプルは1個から承ります。
サンプル量および品質が下記リスト記載の量に満たない場合でも、解析可能な場合がございます。予めご相談ください。

ロングリード(PacBio Sequel)
● 作業内容:クオリティチェック+ライブラリ調製+シーケンサーラン
解析メニュー 取得データ目安 必要サンプル量 納 期
RNA 40万 - 60万リード Total RNA:4 μg以上(100 ng/ul以上) 8週間
DNA 4Gb - 7Gb
(DNAの品質による)
DNA: 10 μg以上(40〜50 kb以上)で4セルまで5セル以上の場合は
4セルごとに10 μgを追加してご送付ください。
QC結果によりDNAに分解が見られた場合は10 μg以上必要な場合もあります。
1サンプルを複数セルで解析する場合も10 µg以上必要な場合があります。
8週間
ゲノム解析
● 作業内容:ライブラリ調製+シーケンサーラン
● オプションで品質確認を希望される場合には8サンプル毎に¥15,000の費用が発生します。
解析メニュー 取得データ目安 必要サンプル量 納 期
全ゲノムシークエンス ご依頼内容ごとに設定 DNA:2 μg以上
(100 ng/μL以上)
4週間〜
Human Exome-Seq
(100bp Paired-End)
8,000万リード、8Gb DNA:2 μg以上
(100 ng/μL以上)
8週間
発現解析
● 作業内容:クオリティチェック+ライブラリ調製+シーケンサーラン
● RNA品質検査費用を価格に含みます。弊社推奨基準を満たさない場合、解析中止、もしくはサンプルの再提出をお願いすることがございます。
品質検査は2回目までは無償で、3回目以降は8サンプル毎に¥15,000です。
解析メニュー 取得データ目安 必要サンプル量 納 期
真核生物 mRNA-Seq
(TypeA; 50 bp Single-Read)
1,500万リード、750Mb total RNA:2 μg以上
(40 ng/μL以上)
4週間
真核生物 mRNA-Seq
(TypeB; 100 bp Paired-End)
3,000万リード、3Gb total RNA:2 μg以上
(40 ng/μL以上)
8週間
miRNA-Seq
(50bp Single-Read)
1,500万リード、750Mb total RNA:4 μg以上
(200 ng/μL以上)
2〜4週間
3'RNA-Seq 100万リード total RNA:2 μg以上
(40 ng/μL以上)
8週間
エピジェネティクス関連
品質確認はオプションとなります。
解析メニュー 取得データ目安 必要サンプル量 納 期
Human Bisulfite-Seq
(100 bp Paired-End)
3,000万リード、3Gb DNA:4 μg以上
(100 ng/μL以上)
8週間〜
MBD-Seq
(100bp Paired-End)
3,000万リード、3Gb DNA:4 μg以上
(100 ng/μL以上)
8週間〜
ChIP-Seq
(50 bp Single-Read)
ご依頼内容ごとに設定 クロマチン免疫沈降後DNA:
100 ng以上(10 ng/μL以上)
お問い合わせ
ライブラリ調製
● 作業内容:ライブラリ調製
● オプションで品質確認を希望される場合には8サンプル毎に¥¥15,000の費用が発生します。
解析メニュー 取得データ目安 必要サンプル量 納 期
mRNA-Seq用 納品物は作製済みの
ライブラリーとなります。
total RNA:2 μg以上
(40 ng/μL以上)
3週間
Total RNA-Seq用 total RNA:2 μg以上
(40 ng/μL以上)
3週間
Human Exome-Seq用 DNA:2 μg以上
(100 ng/μL以上)
3週間
全ゲノム、Target-Seq用 DNA:2 μg以上
(100 ng/μL以上)
3週間
シーケンサーラン(レーン貸切)
● 作業内容:シーケンサーラン
● オプションで品質確認を希望される場合には8サンプル毎に¥15,000の費用が発生します。
解析メニュー 取得データ目安 必要サンプル量 納 期
NextSeq 75 bp Single-Read 4億リード、最大30Gb 4週間
75bp Paired-End Mid 2.6億リード、最大 19.5Gb
150bp Paired-End Mid 2.6億リード、最大39 Gb
75 bp Paired-End 8億リード、最大60 Gb
150 bp Paired-End 8億リード、最大120 Gb
MiSeq 150 bp Paired-End 2,700万リード、4 Gb 4週間
250 bp Paired-End 2,700万リード、6.7 Gb
300 bp Paired-End 4,700万リード、14.1 Gb
150 bp Paired-End Nano 200万リード、300 Mb
250 bp Paired-End Nano 200万リード、500 Mb
HiSeq 50 bp Single-Read 1.86億リード、9.3 Gb 8週間
3億リード、15 Gb 4週間
100 bp Paired-End 3.74億リード、37.4 Gb 8週間
6億リード、60 Gb 4週間
ライブラリのクオリティチェック
解析メニュー 納 期
クオリティチェック(バイオアナライザー) 1週間
濃度測定(定量PCR) 1週間
抗体可変領域解析

5'-RACE法により5'UTRから定常領域までの塩基配列を取得し、シグナル配列部分の開始メチオニンから可変領域の末端部分までの配列を報告します。かずさDNA研究所では大規模cDNAプロジェクトでの経験を生かし、抗体産生細胞からRNA抽出を行い、迅速な可変領域配列の決定を行います。

解析メニュー 納 期
基本解析 3~4週間
CDR同定 1~2週間
このサービスは、プロメガ株式会社を通じてご提供しております。